Une nouvelle analyse met en évidence des écarts entre la  dermatite atopique  et  l'eczéma 

Bien que les termes  » eczéma  » et  » dermatite atopique  » soient généralement utilisés de manière interchangeable, l’utilisation de l’un ou l’autre terme peut avoir des implications sur les méta-analyses, les revues systématiques et l’exploration de texte, selon une nouvelle étude. Les enquêteurs de l’étude ont trouvé des écarts significatifs entre les termes en ce qui concerne le type de littérature et d’informations récupérées grâce à des recherches dans les bases de données. L’équipe, dirigée par Clément Frainay, PhD, School of Public Health, Imperial College London, a recherché les deux termes dans le moteur de recherche PubMed, mettant en œuvre l’apprentissage automatique pour enquêter sur les contextes dans lesquels l’un ou l’autre terme a été utilisé. [chose] le corpus qui précède les récentes recommandations de 2017 sur la terminologie, car leur approbation et leur impact ne peuvent pas encore être correctement évalués au moment de la rédaction. « , ont-ils noté. Frainay et son équipe ont ensuite utilisé une approche d’arbre de décision où ils ont formé un modèle pour prédire si un article serait indexé avec des tags d’eczéma ou de dermatite atopique. Des outils d’exploration de texte ont été utilisés pour extraire les entités biologiques associées à l’un ou l’autre terme.

Résultats

Dans l’ensemble, les enquêteurs ont découvert qu’une requête  » AD  » produisait des articles liés à la science vétérinaire, à la biochimie, à la biologie cellulaire et moléculaire, tandis que  » l’eczéma  » produisait des résultats liés à la santé publique, aux maladies infectieuses et au système respiratoire. De plus, il y avait des différences dans Termes liés à  » AD  » et  » Eczéma  » du thésaurus Medical Subject Headings (MeSH), une ressource qui fournit un vocabulaire biomédical contrôlé. Plus précisément, il y avait un accord de 52% entre les 40 premières listes. « La présence de termes liés aux mécanismes cellulaires, en particulier les allergies et l’inflammation, caractérisait la littérature sur la MA », ont écrit les enquêteurs. « Les métabolites mentionnés plus fréquemment que prévu dans les articles avec étiquette AD différaient de ceux indexés avec l’eczéma. » Ils ont également constaté que l’eczéma produisait moins de gènes enrichis par rapport à l’AD. En outre, les gènes récupérés de la MA couvraient en moyenne 91,2 % du nombre total de gènes récupérés de l’eczéma ou de la MA. Gene Set to Diseases (GS2D) n’a récupéré que 2 gènes via une recherche sur l’eczéma, qui figuraient également dans la recherche  » AD « . Cependant, avec Polysearch, 17 gènes extraits d’une recherche sur l’eczéma n’ont pas été extraits d’une recherche AD.

Perspective

Frainay et son équipe ont souligné les contextes différents dans lesquels les deux termes avaient été utilisés.  » Nos résultats sont un exemple des implications de l’ambiguïté des noms de maladies sur les approches de text mining, et soulignent la nécessité de caractériser, en termes de sujets et de contenu, la littérature associée à chaque terme et de détecter quand deux noms de maladies  » synonymes  » ne le font pas. portent les mêmes informations « , ont-ils écrit. Ils ont suggéré qu’une approche systématique devrait être utilisée en utilisant les deux termes conjointement. Plus encore, ils ont proposé l’apprentissage par arbre de décision comme outil pour identifier et caractériser l’ambiguïté des termes. « Nos résultats devraient sensibiliser au biais potentiel imputé au terme utilisé lorsqu’on s’appuie sur l’approche de text-mining et illustrer l’importance de définir un calendrier approprié et termes lors de l’interrogation de la base de données de publication « , ont conclu les enquêteurs. L’étude  » Dermatite atopique ou eczéma  ? Conséquences de l’ambiguïté du nom de la maladie pour l’exploration de la littérature biomédicale « , a été publié en ligne dans Clinical and Experimental Allergy.